Так, утром 2 марта заместитель командующего Южным военным округом РФ и заместитель командира 810-й бригады морской пехоты ЧФ предъявили ультиматум 1-му батальону морской пехоты ВМС Украины в Феодосии — в течение часа сложить оружие и передать российским военнослужащим склады. В Севастополе был блокирован штаб ВМС Украины, здание было обесточено. Была блокирована 36-я бригада береговых войск, дислоцирующаяся в с. Перевальном (Симферопольский район).
Около тысячи крымских татар попытались выступить в качестве "живого щита" между военнослужащими батальона морской пехоты ВМС Украины (в/ч А-0669) в Керчи и группой вооружённых российских военнослужащих, оцепивших территорию воинской части. С 3 марта украинский флаг был снят, украинские и российские военнослужащие приступили к совместному несению караула.
К вечеру 2 марта бескровно были захвачены штабы Азово-Черноморского регионального управления и Симферопольского пограничного отряда Погранслужбы Украины, установлен контроль над одним из украинских дивизионов ПВО в районе мыса Фиолент.
В ночь со 2 на 3 марта в зале заседаний крымского Совета министров состоялась церемония принятия присяги рядом руководителей силовых ведомств. На верность народу Крыма присягнули начальник Службы безопасности Пётр Зима, начальник Главного управления внутренних дел Сергей Абисов, начальник Главного управления Службы по чрезвычайным ситуациям Сергей Шахов и исполняющий обязанности начальника пограничной службы Виктор Мельниченко (ранее — первый заместитель начальника Азово-Черноморского регионального управления Госпогранслужбы Украины). Ранее, 2 марта, присягу принял контр-адмирал Денис Березовский, назначенный командующим ВМС Крыма. По словам Аксёнова, этот день "войдёт в историю автономии как день формирования всех её силовых структур".
3 марта президиум Верховного Совета АРК заявил, что развитие политической ситуации на Украине "даёт веские основания для опасений за судьбу страны, создаёт угрозу миру и стабильности в Крыму". По мнению президиума, постановление Верховной рады Украины "О самоустранении президента Украины..." нарушило Конституцию Украины, не предусматривающую прекращение полномочий президента по причине самоустранения от их выполнения, поэтому "правовые основания для возложения обязанностей президента Украины на председателя Верховной рады Украины Турчинова А. В.<...>отсутствуют". Парламент АРК, несущий ответственность за обеспечение прав и свобод её жителей, не может оставаться сторонним наблюдателем разрушительных процессов, происходящих в стране, и "именно эти обстоятельства" побудили ВС АРК принять решение "о проведении республиканского (местного) референдума как формы прямого народовластия по вопросам усовершенствования статуса и полномочий автономии". Президиум заявил, что вопрос референдума не содержит положений об отделении АРК от Украины, при этом "мы выступали и выступаем за наделение Крымской автономии широкими полномочиями, которые должны быть гарантированы при любых изменениях центральной власти и конституции Украины". Президиум ВС АРК поддержал перенос референдума о статусе и полномочиях Крыма на 30 марта.
Тем временем из Крыма поступали сообщения о том, что командующий Черноморским флотом РФ Александр Витко якобы предложил украинским военнослужащим сдаться до 5 часов утра 4 марта; в противном случае, российские военные угрожают приступить к штурму подразделений и частей ВС Украины по всему Крыму; в Севастополе казаки попытались захватить штаб ВМСУ при поддержке российских морских пехотинцев, в Севастопольской бухте корабли российского Черноморского флота блокировали корабли ВМСУ "Тернополь" и "Славутич", ракетный катер ЧФ РФ заблокировал выход из озера Донузлав. В Госпогранслужбе Украины заявили, что на паромной переправе Крым-Кавказ происходит накопление бронетехники, продолжаются активные перемещения кораблей российских ВМС в акваторию Чёрного моря на вход и выход из порта Севастополь, российские военные осуществляют моральное и физическое давление на пограничников и активно ведут попытки вербовки персонала.
В Государственной пограничной службе Украины сообщили о прорыве в сторону Украины двух микроавтобусов и трёх грузовиков Камаз с вооружёнными лицами через пункт пропуска паромного сообщения "Крым-Кубань" в Керчи под прикрытием военнослужащих ЧФ РФ. В дальнейшем эта группа вооружённых лиц с применением физической силы захватила место дислокации отдела погранслужбы "Керчь".
Координационный совет Севастополя, "учитывая стабилизацию ситуации в городе", принял решение завершить формирование новых отрядов народного ополчения, поскольку "благодаря активной поддержке жителей" Координационный совет контролирует ключевые силовые структуры обеспечения правопорядка.
Утром 4 марта премьер-министр Крыма Сергей Аксёнов заявил на пресс-конференции в Симферополе, что личный состав украинских воинских частей готов подчиниться новому правительству Крыма и что в отношении командиров, отказывающихся выполнять его приказы, будут возбуждены уголовные дела; "если в результате действий этих командиров прольется кровь, наказание будет жесточайшее для этих руководителей".
4 марта глава СБУ Валентин Наливайченко пожаловался, что российские военные заблокировали работу органов безопасности Украины в Крыму. По словам Наливайченко, СБУ обратилась к российской стороне с требованием предоставления возможности органам безопасности работать, однако "по состоянию на эту минуту ответа нет".
Президент Путин провёл пресс-конференцию о ситуации на Украине, где, в частности, отрицал участие российских войск в крымских событиях, заявив, что там действуют лишь местные силы самообороны. В ответ офицеры-командиры Севастопольской бригады надводных кораблей, кораблей ВМС Украины "Славутич" и "Тернополь" в сообщении для СМИ заявили, что считают себя правомочными "обвинить президента Российской Федерации в неприкрытой лжи", а также сказали, что "в настоящий момент военные корабли ВМС Украины "Тернополь" и "Славутич", находящиеся непосредственно в Севастопольской бухте, блокированы боевыми кораблями и судами Черноморского флота ВМФ России, на каждом из которых находятся подразделения морской пехоты количеством до одного взвода, вооружённые автоматическим оружием и в соответствующей экипировке".
В течение этого дня экипаж корабля управления "Славутич" предотвратил попытку захвата корабля вооружённой группой. Начальник радиотехнических войск Воздушных Сил ВС Украины полковник Сергей Вишневский сообщил, что все командные пункты, радиотехнические батальоны и роты на территории Крыма находятся в осаде российских войск и отрядов крымской самообороны. Российские спецназовцы прорвались на территорию зенитно-ракетного полка под Евпаторией (в/ч А-4519).
Тем временем, как сообщило Радио Свобода со ссылкой на очевидцев, российские военные установили на КПП "Турецкий вал", расположенном на границе Херсонской области и Крыма, усиленный блокпост и окапывают оборонительные позиции для людей и техники. По их словам, на КПП находится около 50 вооружённых российских военнослужащих и военная техника — не менее трёх БТР, шесть-семь бронированных автомобилей "Тигр" (или "Вепрь"), несколько грузовых автомобилей и инженерная техника. Госпогранслужба Украины, со своей стороны, развернула три контрольно-пропускных пункта и выставила пограничные патрули на административной границе с АР Крым. Контрольные пункты были развёрнуты в районе населённых пунктов Сальково, Каланчак и Чаплинка. Согласно информации, эти пункты и патрули усилены военнослужащими мобильных подразделений погранвойск, сотрудниками МВД и военнослужащими ВСУ.
В Симферополе неизвестные вооружённые люди в военной форме заблокировали автомобиль специального посланника Генерального секретаря ООН Роберта Серри, который был вынужден прервать своё пребывание в Крыму и покинуть полуостров. Как прокомментировал этот инцидент Сергей Аксёнов, "мы не направляли им приглашение, они не предупреждали о приезде, обычная в таких случаях процедура не была соблюдена".
Ракетный крейсер "Москва" из состава ЧФ в сопровождении четырёх судов обеспечения встал у входа в бухту Донузлав, блокируя таким образом выход кораблей ВМС Украины.
6 марта командующий ВМСУ контр-адмирал Сергей Гайдук заявил, что в сложившейся в Крыму ситуации украинские военные изо всех сил стараются не допустить кровопролития и жертв среди мирного населения, "не позволить политическим противоречиям разорвать семьи и детей".
6 марта 2014 года. Верховный Совет АР Крым и Севастопольский городской совет приняли решение войти в состав России в качестве субъектов Федерации и провести референдум на территории АР Крым и Севастополя, причём не 30 марта, а 16 марта, вынеся на референдум вопрос о вхождении Крыма в состав России на правах субъекта Федерации или восстановлении Конституции Крыма 1992 года при сохранении полуострова в составе Украины.
Руководство Верховного Совета Крыма заявило, что изменение формулировки вопроса было вызвано реакцией украинских властей на решение о проведении референдума в Крыму, на который ранее не планировалось выносить вопрос о выходе автономии из состава Украины.
Крымские депутаты приняли решение обратиться к руководству России с предложением "о начале процедуры вхождения в состав Российской Федерации в качестве субъекта Российской Федерации".
В течение 6-7 марта через Керченскую паромную переправу круглосуточно переправлялись колонны военного автотранспорта, следовавшие через Керчь в сторону Феодосии. Военные грузы украинскими пограничниками и таможенниками не досматривались.
В ночь с 6 на 7 марта в проливе бухты Донузлав был затоплен списанный большой противолодочный корабль "Очаков", который лёг поперёк пролива, заблокировав выход из бухты украинским судам. Через сутки рядом было взорвано и затоплено водолазное судно БМ 416 типа пожарного катера водоизмещением 30-40 тонн.
7 марта делегация Верховного Совета Крыма во главе с его председателем Владимиром Константиновым встретилась в Москве с председателем Госдумы Сергеем Нарышкиным и спикером Совета Федерации Валентиной Матвиенко. Нарышкин заявил, что в России поддержат "свободный и демократический выбор" населения Крыма и Севастополя. Матвиенко заверила, что сенаторы поддержат решение о вхождении Крыма в состав России, если оно будет принято.
8 марта поступили сообщения о том, что российские военные и крымские ополченцы приступили к обустройству блокпоста на территории Херсонской области (Арабатская стрелка).
8 марта Александр Турчинов назначил новым руководителем Главного управления СБУ в АРК Олега Абсалямова, однако пресс-служба Верховного Совета АРК сообщила, что в Крыму это назначение считают нелегитимным. В Верховном Совете АРК напомнили, что в Крыму создана своя Служба безопасности, начальник которой Пётр Зима назначен в соответствии с Конституцией АРК и регламентом крымского парламента.
9 марта в Симферополе, Севастополе, Евпатории и Керчи прошли митинги в поддержку присоединения Крыма к России. Представители руководства крымской автономии призвали жителей Крыма проголосовать за присоединение к России.
Владимир Константинов заявил в своём обращении к крымчанам на сайте Верховного Совета АР Крым, что передача Крыма Украине в 1954 году без согласия местных жителей представляла собой "вопиющую несправедливость". По словам политика, "Крым исчерпал возможности добиться достойного статуса в составе Украины", а дальнейшее пребывание в её составе "грозит крымчанам не просто унижениями и дискриминацией по культурному и этническому принципу, а самым буквальным физическим уничтожением. <...> Той Украины, в которой мы жили последние 23 года, уже нет, и договариваться в Киеве о совместной жизни в рамках одного государства уже не с кем". Константинов призвал жителей АРК "не упустить шанс, оставаясь крымчанами, никуда не переезжая, вернуться домой — в Россию", которая "поможет адаптироваться" в переходный период.
9-10 марта российские военные установили контроль над аэродромом морской авиационной бригады ВМС Украины в Саках, автобатом (в/ч А2904) в Бахчисарае, отдельной ракетно-технической частью в Черноморском.
Предложение Совета министров АР Крым украинскому 55-му зенитно-ракетному полку в Евпатории передать всё оружие на склад под охрану Черноморского флота России на период подготовки к референдуму о статусе Крыма
10 марта Сергей Аксёнов на встрече с журналистами сообщил, что Верховный совет Крыма наделил его полномочиями главнокомандующего вооружёнными силами и правом формирования вооружённых сил Крыма: "Решение о формировании армии Крыма принято в связи с наличием на территории автономии незаконных вооружённых формирований". В этот же день Аксёнов принял присягу на верность автономии батальона спецназа Вооружённых сил Крыма, в состав которого вошли около ста дружинников полка народной обороны Крыма.
11 марта Верховный Совет АРК и Севастопольский городской совет приняли декларацию о независимости АРК и Севастополя, в соответствии с которой, в случае принятия на референдуме решения о присоединении к России, Крым будет объявлен суверенной республикой и в таком статусе обратится к руководству РФ с предложением о принятии в состав Федерации.
В Верховном Совете Крыма началось формирование межфракционной депутатской группы "За новый российский Крым".
12 марта первый вице-премьер Крыма Рустам Темиргалиев сообщил об ограничении воздушного сообщения Крыма с Украиной на период до 17 марта. По его словам, это сделано "в связи с возможным прилётом сюда провокаторов". Российские военные блокировали радиотехнический батальон на горе Ай-Петри.
13 марта командир 204-й бригады тактической авиации, дислоцирующейся на аэродроме "Бельбек", полковник Юлий Мамчур потребовал от руководства страны дать конкретные указания своим военнослужащим в Крыму, поскольку они находятся под постоянным давлением со стороны российских военных, органов местного самоуправления и даже местного населения, но имеют лишь устное указание не поддаваться на провокации, держаться и не применять оружие. Мамчур потребовал от руководства страны в кратчайшие сроки принять взвешенное решение по дальнейшим действиям командиров воинских частей в случае прямой угрозы жизни личного состава, семей военнослужащих и гражданского населения: "В случае непринятия вами соответствующих решений мы будем вынуждены действовать согласно уставу Вооружённых сил Украины, вплоть до открытия огня. При этом мы чётко осознаём, что не сможем долго противостоять превосходящим по количеству, вооружённости и подготовке подразделениям российских войск, но готовы выполнить свой долг до конца".
Четыре ведущие политические партии Крыма подписали меморандум о всестороннем содействии свободному волеизъявлению крымчан в ходе общекрымского референдума.
