Прежде всего, давайте вспомним, что Банковая, где сидит президент — это здание бывшего штаба Киевского особого военного округа, построенное еще до войны. Поверить, что там не было подслушивающих устройств — не поверю, НКВД всегда следило за военными, а после войны — следило КГБ. Скорее всего, закладки были сделаны еще на этапе строительства здания — вот почему, кстати, мог быть очень плохой звук, просто аппаратура старая. После 1991 года — аппаратуру для прослушивания президента Украины могла расконсервировать СБУ. Вопрос в том, по чьему приказу она могла это сделать?
Первый подозреваемый — Леонид Деркач, на момент событий — глава СБУ. С 1992 по 1997 год он занимал должность заместителя главы СБУ, и отвечал, что характерно — за техническое обеспечение. То есть именно он по должности — отвечал за все мероприятия по прослушке на Украине и знал, где и что установлено. Не мог не знать. А на момент событий он и вовсе — глава СБУ.
Второй подозреваемый — Игорь Смешко. Доктор технических наук. Бывший глава ГУР МО Украины, враг Деркача. Возможно, американский агент (первый украинский военный атташе в США, получил блестящие характеристики). Он курировал Киевский институт связи и защиты информации — а именно этот институт разрабатывал систему защиты от прослушивания на Банковой. Именно Смешко — владел технической информацией по защите кабинета президента лучше кого-либо другого в Украине. Включая и Деркача, так как Деркач — бывший "идеолог", начальник пятого отдела, а не доктор технических наук.
Когда Смешко был главой СБУ — СБУ фактически выступила на стороне Оранжевой революции.
Почти сразу после исчезновения Гонгадзе — начинается акция "Знайдить журналиста Гонгадзе". После "кассетного скандала" — начинается акция "Украина без Кучмы", к которой присоединяются как правые, так и левые: Социалистическая партия Украины, Украинская народная партия "Собор", Украинская республиканская партия, партия "Реформы и порядок", УНА-УНСО, Украинский коммунистический союз молодежи, Всеукраинская партия трудящихся, и другие, всего 24 партии и общественные организации. По стилю акция походит на голодовки 1990 года — 15 декабря 2000 года участники акции разбивают палаточный городок в центре Киева. Требования — отставка президента страны, всех руководителей силовых ведомств, независимая экспертиза "пленок Мельниченко" и расследование дела Гонгадзе.
13 февраля 2001 года президент Л. Д. Кучма, премьер-министр В. А. Ющенко и председатель Верховной Рады Украины И. С. Плющ подписали "письмо трёх", в котором они, обращаясь к соотечественникам, утверждали, что против государства развёрнута "беспрецедентная политическая кампания со всеми признаками психологической войны", и называли происходящее украинской разновидностью национал-социализма.
27 февраля 2001 года Генеральная прокуратура Украины признала факт смерти Георгия Гонгадзе и возбудила дело по статье "Умышленное убийство". До этого — таращанское тело считалось неопознанным.
9 марта 2001 года возле администрации президента Украины состоялись столкновения участников УБК с милицией. Поводом к столкновениям послужила попытка протестующих помешать возложению Л. Кучмой цветов к памятнику Т. Шевченко. Тогда было задержано несколько сот протестующих, а 19 из них были осуждены за "организацию массовых беспорядков" на срок от 2 до 4,5 лет. Демонстрации УБК продолжались до апреля 2001 г. Под давлением акций протеста президент Кучма отправил в отставку министра внутренних дел и председателя Службы безопасности.
В марте 2001 года в газете Financial Times Джордж Сорос призвал президента Кучму временно уйти с должности и отдать власть премьеру Ющенко на время расследования дела Гонгадзе.
15 мая 2001 года Леонид Кучма заявил, что знает имена убийц. На следующий день министр внутренних дел Юрий Смирнов объявил, что убийство не имеет политических мотивов и совершено "из хулиганских побуждений" двумя уголовниками, погибшими в декабре 2000 года.
23 ноября 2002 года Чрезвычайный и Полномочный Посол США на Украине заявляет, что у США нет сомнений в аутентичности записей, сделанных бывшим майором Государственной службы охраны Николаем Мельниченко в кабинете Президента Леонида Кучмы.
В 2002-2003 годах расследование гибели Гонгадзе возглавлял заместитель генпрокурора Украины Виктор Шокин, который заявил о причастности к убийству журналиста сотрудников МВД Украины.
22 октября 2003 года генеральный прокурор Святослав Пискун подписал ордер на арест генерала милиции Алексея Пукача и объявил, что расследование близится к завершению. Начальник департамента внешнего наблюдения МВД Украины генерал Пукач попал в поле зрения прокуратуры после того, как в ходе расследования выяснилось, что его подразделение вело слежку за журналистом. Генерала задержали в его рабочем кабинете и предъявили обвинение в злоупотреблении властью, что вызвало недовольство президента Кучмы;
29 октября 2003 года Кучма уволил генерального прокурора Святослава Пискуна и его заместителя Шокина; следственную группу переформировали, а Пукача выпустили на свободу, сняли с него все обвинения и отправили на пенсию. Генерал Пукач был выпущен из-под ареста в ноябре 2003 года и до 21 июля 2009 года находился в международном розыске.
04 ноября 2003 года в Киеве был взорван джип Toyota Land Cruiser, в котором находился В.К. Кисель, криминальный авторитет, которого считали причастным к пропаже Гонгадзе. Кисель выжил. СМИ классифицировали покушение на него как попытку уничтожить важного свидетеля по "делу Гонгадзе". Сам Владимир Карпович заявил: "К истории с Гонгадзе отношения не имею. Богом клянусь".
В июне 2004 года британская газета The Independent опубликовала материалы следствия, которые содержали показания заместителя главы Управления по борьбе с организованной преступностью Киевской области Игоря Гончарова, арестованного в 2003 году по обвинению в убийстве других лиц (банда оборотней), о том, что похищение и убийство Гонгадзе было осуществлено подконтрольными бандитами по указанию МВД, а именно, по приказу министра Юрия Кравченко от имени президента страны. Сам Гончаров долго после этого не прожил.
В дни "оранжевой революции", в декабре 2004 года, Пискун оспорил своё увольнение в суде, добился восстановления в должности генерального прокурора, привёл с собой старую команду и возобновил расследование. Служба безопасности Украины объявила в розыск Алексея Пукача, который, как сообщил Святослав Пискун, является ключевым подозреваемым и свидетелем в "деле Гонгадзе".
01 марта 2005 года Виктор Ющенко официально заявил, что убийцы Георгия Гонгадзе задержаны. Раньше, по мнению президента, правоохранительные органы не могли раскрыть убийство Гонгадзе, поскольку "предыдущая власть не только не обладала политической волей для его раскрытия", но и "была крышей для убийц". По словам Виктора Ющенко, ему теперь стало понятно, почему при предыдущем генеральном прокуроре страны Геннадии Васильеве убийство не было раскрыто, а следственная группа по этому делу была распущена.
03 марта 2005 года генеральный прокурор Украины Святослав Пискун заявил, что его подчинённые намерены на следующее утро допросить бывшего главу МВД Юрия Кравченко. Депутат Верховной Рады Григорий Омельченко, глава парламентской комиссии по расследованию резонансных дел, в тот же день предложил немедленно арестовать Кравченко, поскольку он "находится на грани самоубийства", а также бывшего начальника Службы безопасности Украины Леонида Деркача и самого Леонида Кучму.
04 марта 2005 года главный свидетель Юрий Кравченко был обнаружен мёртвым на своей даче в элитном поселке "Золотые ворота" в Конча-Заспе под Киевом. Кравченко скончался от двух огнестрельных ранений в голову. По мнению следствия, экс-министр покончил жизнь самоубийством.
23 ноября 2005 года Апелляционный суд Киева принял к рассмотрению уголовное дело по обвинению Николая Протасова, Валерия Костенко и Александра Поповича в преднамеренном убийстве журналиста Георгия Гонгадзе. Слушание прошло в закрытом режиме.
19 декабря 2005 года прошло очередное слушание дела об убийстве Георгия Гонгадзе. Слушание прошло в закрытом режиме, что вызвало критику со стороны СМИ. Даже Виктор Ющенко пообещал тогда, что обратится к суду с просьбой, "чтобы эта процедура проходила открыто, чтобы там были журналисты и камеры".
09 января 2006 года Апелляционный суд Киева начал рассмотрение по существу уголовного дела об убийстве журналиста Георгия Гонгадзе.
29 августа 2006 года мать погибшего, Леся Гонгадзе, заявила, что отказывается от участия в дальнейших процессах, поскольку не доверяет ни ходу расследования, ни
12 июня 2007 года Апелляционный суд Киева продолжил рассмотрение дела об исполнителях убийства журналиста Георгия Гонгадзе в открытом режиме.
25 июня 2007 года Апелляционный суд Киева продолжил рассмотрение дела об исполнителях убийства журналиста Георгия Гонгадзе в открытом режиме. В убийстве журналиста обвиняются три бывших сотрудника Департамента внешнего наблюдения и уголовной разведки МВД Валерий Костенко, Николай Протасов и Александр Попович. Ещё один обвиняемый — бывший руководитель упомянутого департамента МВД Алексей Пукач — находится в розыске.
15 марта 2008 года Апелляционный суд Киева приговорил обвиняемых в убийстве Георгия Гонгадзе Николая Протасова к 13 годам лишения свободы, Валерия Костенко и Александра Поповича к 12 годам лишения свободы; 8 июля того же года Верховный суд Украины оставил приговор без изменения. Николай Протасов скончался в Менской колонии в апреле 2015 года.
22 июля 2009 года задержанный накануне украинскими правоохранительными органами бывший руководитель департамента внешнего наблюдения и криминальной разведки МВД Украины генерал Алексей Пукач признал свою причастность к убийству Георгия Гонгадзе и назвал имена заказчиков, согласно заявлению заместителя главы Службы безопасности Украины Василия Грицака.
24 июля 2009 года Генеральная прокуратура Украины предъявила Пукачу А. П. обвинения в убийстве Гонгадзе и ряде других преступлений, таких как похищение Подольского и уничтожение документов.
28 июля 2009 года в селе Сухолесы (Белоцерковский район), на месте, указанном во время допроса Алексеем Пукачом, были найдены фрагменты черепа, предположительно принадлежащие Георгию Гонгадзе; там же 31 июля экспертами были найдены резиновые перчатки, в которых Алексей Пукач осенью 2000 года мог обезглавливать труп журналиста.
10 сентября 2010 года по данным издания "Зеркало недели", досудебное следствие в деле по обвинению Алексея Пукача в убийстве журналиста Георгия Гонгадзе закончено. По данным ЗН, кроме бывшего начальника департамента наружного наблюдения МВД Украины Алексея Пукача других обвиняемых нет.
22 марта 2011 года заместитель генерального прокурора Ренат Кузьмин заявил, что против Леонида Кучмы возбуждено уголовное дело по подозрению в причастности к убийству Гонгадзе. Ему был ограничен выезд за пределы Украины. На следующий день он прибыл на допрос в генпрокуратуру, но отказался от очной ставки с Николаем Мельниченко.
24 марта у Кучмы была очная ставка с Алексеем Пукачем, после которой ему были выдвинуты обвинения. По его словам, обвинение базируется на плёнках и показаниях Николая Мельниченко и Александра Мороза. 4 апреля всё-таки состоялась очная ставка Кучмы и Мельниченко. 26 апреля было объявлено о завершении расследования.
21 октября 2011 года конституционный суд обнародовал решение, согласно которому обвинение в совершении преступления не может основываться на данных, полученных незаконным путём. 14 декабря того же года Печерский суд Киева отменил постановление генпрокуратуры о возбуждении уголовного дела в отношении Кучмы, признав возбуждение дела незаконным.
29 января 2013 года Алексей Пукач приговорен к пожизненному лишению свободы за убийство Георгия Гонгадзе
В приговоре в частности сказано:
...
Примерно 13-14 сентября 2000 года в своем служебном кабинете в городе Киеве по улице Богомольца, 10 министр внутренних дел Кравченко Ю. Ф. устно отдал начальнику ГУКП МВД Украины Пукачу А. П. явно преступный приказ — убить журналиста Гонгадзе Г. Р. для прекращения таким образом журналистской деятельности
...
Убийство было совершено в ночь на 17 сентября 2000 года в лесу в Киевской области сотрудниками милиции Протасовым, Поповичем, Костенко и Пукачем.
Примерно в полночь Попович, по указанию Пукача, недалеко от места остановки автомобиля, в котором уже находился Гонгадзе, выкопал лопатой яму, приблизительной шириной 70 см и глубиной метр. В это время Протасов и Костенко оставались в служебном автомобиле Hyundai Sonata, удерживая Гонгадзе. Далее Протасов, Костенко, Попович и Пукач вывели Гонгадзе, сняли с него куртку, уложили на землю и сняли с него ботинки. После этого Костенко связал верёвкой руки и ноги Гонгадзе. Пукач, Протасов и Костенко отнесли связанного Гонгадзе к выкопанной яме и уложили лицом вниз. Костенко, по указанию Пукача, обыскал Гонгадзе, забрал у него из заднего кармана ключи и передал их Пукачу.
После этого его положили лицом вверх. Гонгадзе начал просить не убивать его. Пукач запихнул в рот Гонгадзе носовой платок и начал руками сдавливать его горло и шею, а Протасов держал Гонгадзе за плечи. Поскольку так задушить Гонгадзе не удалось, Попович вытащил из брюк Гонгадзе ремень и передал его Пукачу. Пукач набросил его на шею Гонгадзе, упёрся коленями в область груди и начал затягивать. В это время Протасов держал Гонгадзе за правое плечо, а Костенко за ноги. Гонгадзе набрал в лёгкие воздуха. По указанию Пукача, Попович для того, чтобы заставить Гонгадзе выдохнуть воздух, нанёс несколько ударов в область живота. После полученных ударов Гонгадзе выдохнул. Из-за сдавливания шеи петлей с ремня, Гонгадзе был сломан кадык. Начались конвульсии. Протасов и Костенко держали Гонгадзе за ноги до самой смерти.
Гонгадзе умер около 01:00 17 сентября. Удостоверившись, что он мёртв, Пукач, Протасов и Костенко сбросили его тело в яму. С целью скрыть совершение преступления, они взяли из автомобиля канистру с бензином, облили тело и подожгли. Когда огонь погас, Пукач, Протасов, Костенко и Попович забросали яму с телом землей и замаскировали травой.
В октябре 2000 года Пукач с целью скрыть преступление ещё раз прибыл на место захоронения Гонгадзе, выкопал его и отвез в лесничество Таращанского района Киевской области. С помощью топора он отчленил голову от тела, закопав обезглавленное тело и отдельно голову
Пукач заявил, что смерть Гонгадзе была несчастным случаем. По его словам, он набросил ремень на шею журналисту, чтобы напугать, а смерть была несчастным случаем, поскольку ремень случайно переломал хрящ на шее Гонгадзе. После оглашения приговора Пукач заявил, что согласится с ним лишь в том случае, если в одной клетке с ним окажутся Леонид Кучма и Владимир Литвин.