Доложив Юрии о встрече с неизвестным врагом, Ичия, носящий восемь клинков императора, и Чио, владеющая шестью, ожидают приказов. Юрия отправляется к столице страны Демонов одна, оставив командование на младшего брата. Ли начинает показывать признаки обеспокоенности.
Идя по следу Рока Ли, Омега и ее отряд натыкаются лагерь армии Юрии. Ища связь между демоническими захватчиками и искомом преступнике, шиноби догадываются, что здесь замешан Узумаки Наруто, прячущийся в стране Демонов под крылом жрицы. Под давлением Саске и Итачи Омега соглашается напасть на Узумаки и выяснить местонахождение его напарника.
Юрия встречается с Наруто и, отметив уровень его силы, называет того "чудищем прошедшей эпохи" Из короткого разговора выясняется, что Юрия и все воины ее войска — демоны, подобные Биджу, которых создал Гун-кар. Юрия, как и Кьюби, — сильнейшая из своего вида. На агрессию со стороны Наруто девушка отвечает отказом — по ее мнению эта схватка принесет больше вреда ее вторжению, чем пользы, так как результат ее непредсказуем.
В середине их разговора происходит нападение отряда Омеги. Учихи, бессильные против Наруто, пытаются атаковать Юрию, но та легко справляется с ними, а затем исчезает. Тем временем Омега — носительница генома Грома (Ветер+Молния=разрушительные волны звука) и Кимура — сильнейший мечник мира, практически на равных ведут бой против Наруто. Изловчившись, Шикамару умудряется на мгновение парализовать противника, и его товарищи не теряют врямени даром. Кимура тяжело ранит Узумаки, но оказывается беззащитен против черной йокай и выбывает из боя. Омега же использует свою технику Грома, чтобы создать атаку ужасающей мощи, которая успешно блокируется Наруто. Уже мысленно отпраздновав победу Наруто собирается добить противников, но Кимура, вошедший в режим отшельника Сокола, спасает своих товарищей. Битва проиграна, но Шикамару успевает поднять с земли несколько волос, которые Кимура срезает с головы Наруто.
Рок Ли вновь видит призрак матери. Та зовет его в путь, и покалеченный преступник уходит вслед за призраком под покровом ночи.
Наруто ранен после битвы с двумя легендарными шиноби, и именно этот момент выбирают Девять Копий, чтобы напасть. Товарищи Йомея легко захватывают дворец и берут Шион в плен, так как кулон жрицы лишился своей силы после уничтожения Морё. Наруто обнаруживает руины места, бывшего ему домом четыре года, и записку от Йомея с вызовом на в Долине завершения. Обезумевший от ненависти и страха за любовь своей жизни, Наруто отправляется к назначенному месту. Юрия, наблюдавшая за произошедшим, собирается преследовать Наруто, но на армию Императора нападает отряд мутантов Весны, задержав демонов Гун-кара.
Наруто прибывает в Долину, где встречает Йомея и израненную Шион. Вместо приветствия Йомей швыряет в лицо Узумаки тело выкидыша, случившегося у Шион. Наруто теряет разум и вступает в схватку со всеми Девятью Копьями. Отряд Йомея побеждает Наруто, и их лидер заставляет того смотреть, как Шион сначала насилуют, а потом жестоко убивают. В это время напарники Йомея исчезают, а сам Йомей начинает избиение потерявшего рассудок Наруто. Практически убив противника, Йомей рассказывает правду о нем, Отце и грандиозном плане.
Оказывается, Отец — это древнее существо, создавшее и поделившееся чакрой с окружающим миром. Будучи изначально почти неразумным, Отец начал жить среди людей и испытывать чувства, присущие только смертным. Но разум и душа этого древнего создания не были способны справиться с гневом, злобой и прочими отрицательными эмоциями, которые оно впитывало долгие годы. И каждый раз, когда тьма переполняла Отца, он создавал зверя. Сначала был Ичи, ставший первым и слабейшим из детей Отца, впитавших его тьму, а последним стал сам Кьюби — Факир цирка многоуважаемого Эн-сана. Отец (Эн) хотел использовать свои силы и мощь своих детей, чтобы защитить мир от бушующих Божеств. Цирк Эн-сана долгие годы путешествовал по миру, уничтожая и запечатывая тех, кого позже стали звать павшими. Но когда все кончилось и в мире не осталось никого, кто не угрожал бы так полюбившимся Отцу людям, Эн-сан познал величайший страх перед своими детьми. Те, выросшие и окрепшие, стали намного сильнее и, хоть и любили своего Отца всем сердцем, были созданиями порока и тьмы. И тогда та часть Отца, что руководствовалась чувствами любви к детям, отделилась от той, что разумно хотела уничтожить своих опасных детей.
Эн-сан хотел уничтожить девять Биджу, в которых превратились его дети, но его другая часть — тот, кого стали звать Рикудо, защитил девятерых, спрятав их внутри человеческих младенцев подальше от глаз Отца. Так и началось противостояние, длящееся тысячи лет.
Отец знал, что уничтожить Биджу можно лишь одним способом — вновь сделать их частью себя, но злоба и гнев от предательства создателей сделал детей Эн-сана слишком сильными.
Йомей и Девять копий были решением, которое нашел Отец. Будучи младенцами, носители демонов подвергались особой технике клонирования, которую изобрел Орочимару, и демоны отделялись от джинчурики, потеряв свои воспоминания. План отца сделал из Биджу людей, которые в будущем должны были быть поглощены своими джинчурики. Таким образом Биджу теряли связь со своей древней тьмой, которую должны были победить натренированные джинчурики.
Йомей снимает маску, под которой обнаруживается лицо самого Наруто, какое оно стало бы, не искалечься он в детстве. Становится ясно, что изоляция всех "джинчурики" в убежищах нужна была для того, чтобы биджу полностью осознали себя как люди и могли быть поглощены настоящими носителями — Девятью копьями. И лишь с Наруто, которого Третий пытался уберечь от лишних страданий, избежал пожизненного заточения, из-за чего темная натура Кьюби смогла проснуться и повлиять на ребенка.
Главный герой понимает, что в то время как он страдал от недоедания, боролся за жизнь и превращался в чудовище, настоящий Наруто Узумаки жил относительно нормальной жизнью. Вся его жизнь оказалась сплошным обманом, и он сам — не более, чем клон, слепок сущности человека, в котором дремал и растворился девятихвостый. Главный герой оказывается в подсознании и пытается найти опровержение словам врага у Кьюби, но клетка, в которой сидит демон, рассыпается на осколки, в каждом из которых видно изуродованное лицо отступника.
"Наруто" отказывается признавать бездарность своего существования и пытается бежать, но настоящий Наруто уже активирует печать рассеивания. Тело главного героя рассыпается в пыль, и с каждой секундой он все четче понимает, для чего нужен был весь этот фарс. Лидер девяти копий понял, что сила демона строится на тьме и душевной злобе, и чтобы не потерять источник такой мощи, он заставил своего клона потерять все, что ему так дорого. Убийство Шион не стало простой прихотью орудия Отца, это был план по полному растворении демона его черной сущности в сознании человека.
Главный герой исчезает, чтобы его сознание, память и сила перешли к Наруто Узумаки и начали растворяться в оригинале. Наруто падает на землю, крича от боли, остальные члены Девяти Копий, настоящие Джинчурики, полностью растворившие в себе то, что уже не было демонами, но не успевшее стать людьми, хватают лидера и переносятся с поля боя. Наруто, в чьем разуме борются две совершенно разные сущности, использует всю силу воли, чтобы подавить свою тьму, растворить ее в себе и принять то, чем двадцать лет был отступник Листа, Бешенный Демон. Наруто чувствует то, что не чувствовал он, но познал его клон и понимает, что теперь обречен на вечные страдания. Кьюби был монстром, черпавшим все свои силы из ненависти, которая так и осталась гореть внутри него. Но только теперь все изменилось: больше всего на свете Наруто Узумаки ненавидел себя.
Ли, ведомый призраком матери, приходит к разрушенной темнице Морё. Павший погиб, но его воля и сила витает в воздухе, именно они призвали калеку себе в помощь. Морё возрождается слабее в тысячи раз, и пытается захватить тело Ли. Из-за этого спавший разум Рока вновь становится ясным, и сила воли отступника заставляет подавить древнее божество на некоторое время. Используя полученную силу, Ли переносится к единственному сохранившемуся хранилищу Червей и пересаживает их в свое тело. Постоянная боль не дает ему потерять рассудок вновь, и теперь Ли, захвативший одного из Павших ясно видит причину всех своих страданий — шиноби. Морё шепчет своему носителю, что другие Павшие тоже хотят отомстить своим пленителям и готовы помочь разрушить этот предавший их мир. Ли отправляется за оставшимися Павшими, чтобы собрать в себе всю мощь тех, кого шиноби заставили страдать во тьме.
Шикамару в отчаянии ищет встречи с Павшим, что в древности даровал его клану власть над тенями. Он принимает узы рабства, обретая силу, и присоединяется к остальным Проклятым кланам. Война идет к своему логическому концу. Альянс шиноби с огромными потерями берет столицу Весны и пленяет королеву Юкиэ. Армия Гун-кара сметает все на своем пути и на военном совете принимается решение объединить силы шиноби и мутантов Весны, чтобы дать им отпор. Тем временем Юрия и восемь самых сильных воинов Императора получают приказ Гун-кара возвращаться в Империю. Не имея на себе груз в виде более слабых собратьев, Девятка Императора в считанные дни выполняет приказ.
Происходит генеральное сражение, в ходе которого сталкиваются демоны из армии Империи и силы Пяти Стран. Внезапно вмешиваются Акацуки и Обито вместе с возрожденным Мадарой и Проклятыми кланами становятся третьей силой. Кровопролитная битва находится в своем пике, когда появляется Ли. Отступник поглотил всех выживших Павших и с помощью своей новой невероятной силы выкашивает ряды сражающихся. Битва заканчивается полным разгромом всех трех сторон от руки Рока. Мадара вспоминает голоса Павших, что мучали его половину жизни, и понимает, что именно это тот конец, которого желали Боги — окончательное уничтожение всего, что живет на земле. Шикамару из последних сил пытается сразить ненавистного врага, но погибает. Напоследок он проклинает Наруто и Ли, которые принесли ему столько страданий, на вечные муки. Обезумевший Ли уничтожает остатки армий и обращает свой взгляд на запад — туда, откуда чувствуется последняя чакра, созданная Отцом.
Девять копий готовятся отдать свои жизни Отцу. Тот, по его плану, должен поглотить своих детей, превращенных в людей, чтобы обрести ту мощь, которой владел в самом начале времен, и уничтожить свою вторую половину — Рикудо, воплощенном в Черном Орле Империи. Все идет по плану, когда последний из Девяти копий — Наруто, внезапно не чувствует в груди биение чужеродной силы. Это оказывается бубенец Шион, который она поместила внутрь тела того, кто убил ее. Взяв колокольчик, Наруто видит последнее послание женщины, которую любил больше жизни и которую сам же отправил за грань. Шион говорит, что предвидела всю эту войну и ее возможное окончание. Она знала о судьбе, которая уготована ей, а также о том, какую ношу взял на себя Наруто. Она говорит, что в результате плана Отца этот мир окажется уничтожен вместе со всем живым и мертвым, но она также понимает боль, которую испытывает Наруто. Она знала, что Наруто бесконечно предан Эн-сану, но она никогда не хотела, чтобы ее любовь нашла забвение в своих страданиях и ненависти к самому себе. Напоследок Шион вновь клянется Наруто в вечной любви и напоминает ему, что несмотря ни на что он остается человеком, а не демоном.
Отец поглощает своих детей, и настает черед Наруто. Но тот сомневается. Та часть его существа, что сильнее и увереннее в себе, говорит, что эта судьба была предначертана ему задолго до того, как он родился. Но ненависть демона, резонирующая с дикой любовью к умершему человеку не хочет погибать от руки предавшего своих детей Отца. Наруто делает выбор и бросает вызов Эн-сану.
Завязывается неравная схватка, в которой Наруто понимает, что никогда не хотел быть простым сосудом для тьмы зарвавшегося божества. Но Отец невероятно силен и постепенно одерживает верх над Наруто. Внезапно появляется Гун-кар в окружении своей собственной Девятки. Юрия и ее собраться помогают Узумаки восстановить силы, пока две половины одного существа противостоят друг другу. Юрия и остальные воины императора отдают Наруто свои клинки, говоря, что в них запечатана вся сила их повелителя. Наруто узнает, что если Эн-сан так страшился своих детей, что был готов предать их забвению, то Рикудо воплощал настоящую отцовскую любовь к девяти Биджу. И вся эта война была лишь для того, чтобы одна часть создателя Цирка смогла скопить силы и дать хотя бы одному из преданных детей шанс одолеть обезумевшего от страха Отца и выжить. Наруто принимает этот дар, и его сила возрастает многократно, прежде чем Отец все-таки поглощает свою вторую часть, а Юрия и остальные воины Империи погибают, отдав все свои силы Узумаки.
Схватка продолжается, но теперь силы равны. В тяжелой битве Наруто одолевает Отца. Тот не понимает, как это возможно, на что Узумаки отвечает ему, что страх, которым жил эти века Эн-сан, — низшее из всех возможных человеческих чувств, а ненависть, которую он породил в своих детях способна затмить даже страх.
Наруто убивает Эн-сана и понимает, что уничтожил источник всей чакры в мире. Его силы начинают угасать, когда появляется Ли. Тот уже лишился человеческой природы, оставив только древнюю ненависть ко всему живому. Наруто вступает в битву с бывшим напарником, но вскоре понимает, что его силы исчезают с каждой секундой, когда Павшие подпитываются от невероятного безумия Ли. Наруто знает, что не сможет победить Ли и принимает единственное возможное решение — он использует остатки почти бесконечной силы Отца, чтобы стереть Павших Богов из пространства и времени так, будто тех и вовсе никогда не существовало. Ему это почти удается, когда Ли, ведомый терзающим его безумием хватает Наруто, чтобы утащить того в абсолютное небытие вместе с собой. Наруто не сопротивляется, потому что понимает, что не будь его и Павших в истории мира, Шион смогла бы прожить свою жизнь. Узумаки завершает свою технику, стирая всех Богов, Отца и самого себя из реальности.
В эпилоге Шион, родившаяся и выросшая в обычной сельской местности, собирается отправиться в храм, чтобы отблагодарить высшие силы за ее ребенка, которого она носит под сердцем. Отцом оказывается ее друг детства и старый друг. Шион спокойно проживает свою жизнь в мире, где нет шиноби, Павших богов и Отца. За всем этим бесконечное количество наблюдает Наруто, запертый навечно в абсолютном небытие вместе с безумным Ли. Узумаки счастлив за свою любовь, несмотря на то, что платой за его деяниями стало вечное пребывание в собственных страданиях и мире несбывшихся желаний.
"Я смотрел на ее счастливую жизнь и понимал, что это лишь фантазии моего воспаленного разума. Ее смерть была на моих руках и я... Я не против, если придется вечно страдать, не в силах обрести забвенье. Я безумен, но счастлив, если моя любовь жива хотя бы в моих мечтах.
— Мама... мама...
— Заткнись, утырок, — устало рычу я. — Нет твоей мамы. И нас тоже нет. Не было. И знаешь, что? Никогда и не будет".
