[1] Уважаемые читатели, автор не биолог ни разу, поэтому извиняюсь за некоторые неточности в терминологии. Так, ДНК состоит не из аминокислот (из них состоят белки и их куча, основных — 22), а из нуклеотидов (дезоксирибоза с навешанными на нее отстатком фосфорной кислоты и азотистым основанием). Азотистых оснований входящих в состав нуклеотидов известно как раз 5: аденин, гуанин, цитозин, тимин (только ДНК), урацил (только РНК). Секвенирование полимеразы не имеет смысла и вообще невозможно, так как полимераза — белок, собирающий ДНК (или РНК) в цепь из отдельных нуклеотидов, состоит из аминокислот, а секвенирование позволяет определить последовательность нуклеотидов в молекуле, т.е. секвенируют ДНК или РНК (одним словом — нуклеиновые кислоты).

В предоставленном образце стандартные нуклеотиды имеются, наоборот, там есть три лишних, неизвестных. Может быть недостаток нуклеотидов в расходниках для секвенирования т.е. разрывы в итоговом материале ввиду отсутствия в расходниках двух нуклеотидов, комплементарных неизвестным (к одному из неизвестным должен подойти известный тимин, хотя я и не представляю, как его будут различать с уроцилом)

Двойная цепь — не есть нормальная земная. У нас тут имеются и гаплоидные, триплоидные и многие другие полиплоидные организмы. Это бактерии и водоросли, растения, грибы, а так же простейшие и некоторые другие животным. Квадруплексная спираль... ну, вроде как возможна, с некоторыми оговорками (https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/5c/G-quadruplex.svg/400px-G-quadruplex.svg.png). А может, имеют место вторичные структуры...

Переводчик тоже не биолог, так что спасибо за консультацию читателям Ц3нз0р и Семаргл с самиздата.

[2] См. омаки в главах 96, 99 и 100.